屏東基督教醫院由BSI英國標準協會之協助於2008年9月順利通過ISO 9001:2000之品質管理系統驗證，授贈當天屏東基督教醫院舉行盛大的領證儀式（圖一及圖二），由此可見其對於醫院品質管理系統的重視；醫療機構雖非同一般企業以營利為目的，但卻仍然是需要有良好、完善的品質管理系統來降低醫院成本，維持營運，如此，民眾將有最佳的醫療照護而維持身心健康。
屏東基督教醫院秉持著一貫的宗旨『藉著神的愛與能力，經由醫療等服務，恢復人的健康與尊嚴』之精神，從早期開辦的原住民特別門診／偏遠地區暨離島醫療效益提昇計劃等…多年來從不間斷的為南部地區居民服務，並為弱勢民眾提供援助，另外，為提昇醫療品質，增加醫療設備，全院E化，整合健檢流程，這些都是屏東基督教醫院為民服務、謀健康的最佳典範。
目前全球所使用最普遍的品質架構是ISO 9001，此架構設定的標準不僅用於品質管理系統，同樣也適用於其他一般管理系統，所以各組織內貫徹實行此一標準將有助於減少不必要的浪費、提昇服務品質及消除經營障礙；BSI英國標準協會為百年經營的驗證公司，對於各行各業都有著豐富的標準驗證經驗，BSI協助屏東基督教醫院建立的品質管理系統，除了奠定醫院營運持續的良好根基外，同時，亦期望間接的為民眾帶來更多健康福祉。
